«علی افشاری»، فعال دانشجویی و عضو «دفتر تحکیم وحدت» در دهه ٧٠ شمسی برای نزدیک یک سال در زندان اوین و بازداشتگاه ٥٩ سپاه پاسداران در پرونده «براندازی خاموش»، با دستور قاضی حداد بازداشت بود. بازداشت او با دستگیری تعداد زیادی از فعالان ملی مذهبی از سوی تیم اطلاعات موازی در سپاه پاسداران و نیروی انتظامی همزمان شده بود.
علی افشاری در مورد قاضی حداد میگوید: «حداد مصداق بارز عدم استقلال دستگاه قضایی در برابر نهادهای امنیتی بود. آن زمان نهادهای اطلاعات موازی در حال برنامهریزی یک شبهکودتا علیه دولت محمد خاتمی بودند و برای همین به بازداشت گسترده منتقدان و مخالفان روی آوردند. قاضی حداد ویترین قضایی همان تیم اطلاعات موازی بود که بیشتر مجری دستورات "حسین طائب"، اخراجیهای وزارت اطلاعات و دیگر سازمانهای اطلاعاتی بود.»
قاضی حداد به علی افشاری گفته بود پیش از انقلاب، از طرفداران «حبیبالله پیمان»، فعال ملی مذهبی بوده و بعد از آن که به گفته خودش، به افکار «التقاطی» این نیروها پی برده، از آنها فاصله گرفته است.